Elle concentre son enseignement sur les thèmes des compétences de gestion et du développement de carrière des cadres et sur la gestion du changement dans les organisations publiques. Madame Guay est également impliquée à l'ENAP dans les projets de la Didacthèque internationale en management public reliés à la carrière des femmes.
Elle a prononcé plusieurs conférences, au Québec et à l'étranger, sur la gestion des changements organisationnels, la formation et le développement de carrière des cadres ainsi que sur le mentorat dans le secteur public. Elle a dirigé un collectif sur la performance dans le secteur public publié aux Presses de l'Université du Québec et elle est l'auteure de plusieurs articles à caractère scientifique ou professionnel.
Récipiendaire en 2000 du premier prix d'excellence en enseignement de l'ENAP, Marie-Michèle Guay a également reçu en 2002, le prix Pierre DeCelles décerné par l'Institut d'administration publique du Canada (IAPC), pour l'excellence de son enseignement en administration publique.
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